Термин «клубень» в садоводстве зачастую используется неправильно: так называют практически любой утолщенный запасающий орган, образующийся преимущественно в земле. В действительности же клубень – это однолетний подземный побег растения с утолщенным стеблем, часто имеющим сферическую форму, и зачаточными листьями. Настоящий клубень образуют не очень много растений. Пожалуй, наиболее известное среди них – картофель. У растений с супротивным расположением почек, например у земляной груши, клубни имеют бугорчатую форму, чем отличаются от картофеля со спиральным расположением почек. У некоторых кувшинок в конце периода вегетации также иногда появляются мелкие клубневидные образования.